Основным структурным подразделением СКК Центра является отдел технического контроля.

Отдел технического контроля осуществляет входной и технический контроля сырья, материалов, полуфабрикатов, комплектующих изделий и составных частей разрабатываемой и поставляемой продукции.

Главной задачей ОТК является предотвращение выпуска (поставки) Центром некомплектной продукции или продущии, не соответствующей установленным требованиям (требованиям нормативно документации, условиям договоров или государственных контрактов), а так же постоянное ведение претензионной и рекламационной работы с поставщиками материалов и комплектующих изделий с целью достижения требуемого качества поставляемой ими продукции.

Эта работа проводится совместно с руководителем производственного отдела, осуществляющим регистрацию и учет претензионных и рекламационных случаев, возникающих на всех этапах жизненного цикла научно-технической продукции. Для ведения рекламационной деятельности с Заказчиками в Центре создана служба сервисного обслуживания и ремонта.